StarLighter Probe qPCR Mix (Universal)
产品简述:
StarLighter Probe qPCR Mix (Universal) 是一款基于探针法对各种来源的DNA样本进行快速定量、实时分析的通用试剂盒。性能优异的热启动基因工程改造Taq DNA polymerase,配合基于探针法qPCR优化的缓冲液,可以有效抑制非特异性扩增,大大增加qPCR扩增效率,适用于进行高灵敏度的qPCR反应。参比染料ROX随试剂盒提供。
本产品使用前只需要加入引物、模板、探针、ROX(根据使用的机型而定)和水。定量范围宽,可以对靶基因进行准确的定量、定性和SNP检测;本产品具有重复性好,可信度高,并兼容各种不同类型的qPCR探针的特点。
产品优势:
l 扩增特异性强,数据结果可靠;
l 高GC模板扩增能力强;
l 扩增效率高,Ct值提前 ;
l 信噪比高,低copy检测灵敏度高。
产品应用:
l 基因表达分析;
l SNP和等位基因分型;
l 测序和微阵列结果的验证。
产品性能比较:
利用ARMS-qPCR技术对ApoE两个基因亚型ApoE2、ApoE3进行分型:以携带ApoE3基因亚型的人类基因组为模板,设计两对亚型特异性引物(对应亚型可以扩增,非对应亚型不能扩增。与某竞品平行测试。
ACTB:内参基因;ApoE: 待测基因(片段长度197bp,GC含量71%)
1、扩增特异性强,数据结果可靠
Fig1:使用StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)试剂,利用携带ApoE3基因亚型的人类基因组为模板,AopE2没有扩增,AopE3扩增良好,说明StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)目的产物扩增特异性好; 竞品未能扩增出高GC片段。
2. 高GC模板扩增能力强
Table1:使用StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)试剂,利用携带ApoE3基因亚型的人类基因组为模板,和竞品ct值比较
模板 5ng | Ct值ApoE2 | Ct值ApoE3 |
StarLighter Probe qPCR Mix(Universal) | >45 | 28.08 |
竞品 | >45 | >45 |
Fig2:以人基因组为模板,模板浓度分别为50ng、5ng、0.5ng、0.05ng,扩增ApoE3基因,扩增片段长度197bp,GC含量71%。使用StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)试剂可得到有效扩增,而竞品没有扩增出ApoE3(Ct>45)。
3. 普通GC含量模板扩增效率高,梯度稀释线型范围好
a、StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)与竞品扩增内参基因ACTB比较
Fig3:以人基因组为模板,模板浓度分别为50ng、 5ng、0.5ng、0.05ng,扩增内参基因ACTB基因,扩增片段长度179bp,使用StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)可有效扩增ACTB基因,扩增效率和R2值均优于竞品。CT值比竞品提前约1-1.5个cycle。
4、低拷贝模板检测灵敏度高
Fig4:以人类基因组为模板,模板起始浓度为100ng,将模板进行5倍梯度稀释,使用StarLighter Probe qPCR Mix (Universal)试剂。当模板浓度低至0.032ng时,内参基因ACTB和目的基因ApoE3仍能得到有效扩增,且起始模板量的log值和其Ct值线性关系良好。
5、高稳定性
Fig5:不同冻融次数对StarLighter Probe qPCR Mix (Universal)试剂的稳定性影响,加入不同起始量模板情况下,不同冻融次数的扩增曲线重复性良好。
Fig6 : 37℃处理5天对StarLighter Probe qPCR Mix (Universal)试剂的稳定性影响。加入不同起始量模板情况下,37℃储存5天试剂的扩增曲线与未经37℃处理的试剂的扩增曲线重复性良好。
Fig7 : 室温处理28天对StarLighter Probe qPCR Mix (Universal)试剂的稳定性影响。加入不同起始量模板情况下,室温处理28天试剂的扩增曲线与未经室温处理的试剂的扩增曲线重复性良好。(本实验在Q6上完成)
Fig8 : 4℃处理43天对StarLighter Probe qPCR Mix (Universal)试剂的稳定性影响。加入不同起始量模板情况下,4℃处理43天试剂的扩增曲线与未经 4℃处理的试剂的扩增曲线重复性良好。(本实验在Q6上完成)
产品在人类基因分型中的应用实例:
实例一
以已知分型的不同个体人类血液提取的基因组为模板,设计ApoE基因亚型特异性引物,使用StarLighterProbe qPCR Mix(Universal),通过qPCR扩增对不同个体携带的ApoE基因进行分型,得到的分型结果与已知分型情况一致。
Table2:不同个体人类基因组ApoE分型
StarLighterProbe qPCR Mix(Universal)分型 | 已知分型 | ||||
样本编号 | 基因型 | rs429358 | rs7412 | rs429358 | rs7412 |
201907000001 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000002 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000003 | e2/e3 | TT | CT | TT | CT |
201907000004 | e2/e3 | TT | CT | TT | CT |
201907000005 | e2/e4 | TC | CT | TC | CT |
201907000006 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000007 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000008 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000009 | e3/e4 | TC | CC | TC | CC |
201907000010 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000011 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000012 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
实例二
G719S(18外显子)、T790M(外显子)是位于表皮生长因子受体(EGFR)基因不同外显子上的突变点,这些突变与肺癌,宫颈癌等癌症的靶向用药有关。G719S(18外显子)、T790M(外显子)两个突变的筛查可用于指导不同靶向药物的使用。
通过将待检测突变位点设计在探针中间,以人类基因组为模板,通过qPCR基因分型结果可以判断是否携带该突变。
Fig9:使用StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)和竞品进行基因分型,结果一致
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