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为了对cfDNA测序所有工作流进行质控，以降低不恰当的操作带来的假阴性或阳性的风险，Horizon研发了这款人工合成血浆形式的cfDNA标准品--Multiplex I cfDNA Reference Standard Set in Synthetic Matrix，包含8个肿瘤相关基因突变，可以质控由提取开始的整个工作流程。
技术信息：
Multiplex I cfDNA Reference Standard Set in Synthetic Matrix覆盖8个经基因工程改造的单核苷酸突变位点(SNVs/SNPs)，含多重突变频率，分别为5%，1%和0.1%的等位基因突变频率。每个批次的特定基因拷贝数都经过ddPCR精确定量。
涵盖基因：EGFR, KRAS, NRAS, PI3KCA
等位基因突变频率：5%, 1%, 0.1% 和 0% (100% 野生型)
缓冲液：合成血浆
预期DNA产出量：≥120 ng DNA (QIAamp® Circulating Nucleic Acid Kit提取)
片段大小：170bp
产品规格：400ng/ml (共4管)
验证过的突变基因：
100% Multiplex I 野生型 cfDNA 参考标准品 (组份货号: HD815) | |||
染色体 | 基因 | 突变类型 | 预期等位基因突变频率 % |
7p12 | EGFR | L858R | 0.00% |
7p12 | EGFR | ΔE746 - A750 | 0.00% |
7p12 | EGFR | T790M | 0.00% |
7p12 | EGFR | V769 - D770insASV | 0.00% |
12p12.1 | KRAS | G12D | 0.00% |
1p13.2 | NRAS | Q61K | 0.00% |
1p13.2 | NRAS | A59T | 0.00% |
3q26.3 | PIK3CA | E545K | 0.00% |
5% 等位基因突变频率Multiplex I cfDNA 参考标准品 (组份货号: HD812) | |||
染色体 | 基因 | 突变类型 | 预期等位基因突变频率 % |
7p12 | EGFR | L858R | 5.0% |
7p12 | EGFR | ΔE746 - A750 | 5.0% |
7p12 | EGFR | T790M | 5.0% |
7p12 | EGFR | V769 - D770insASV | 5.0% |
12p12.1 | KRAS | G12D | 6.3% |
1p13.2 | NRAS | Q61K | 6.3% |
1p13.2 | NRAS | A59T | 6.3% |
3q26.3 | PIK3CA | E545K | 6.3% |
1% 等位基因突变频率Multiplex I cfDNA 参考标准品 (组份货号: HD813) | |||
染色体 | 基因 | 突变类型 | 预期等位基因突变频率 % |
7p12 | EGFR | L858R | 1.0% |
7p12 | EGFR | ΔE746 - A750 | 1.0% |
7p12 | EGFR | T790M | 1.0% |
7p12 | EGFR | V769 - D770insASV | 1.0% |
12p12.1 | KRAS | G12D | 1.3% |
1p13.2 | NRAS | Q61K | 1.3% |
1p13.2 | NRAS | A59T | 1.3% |
3q26.3 | PIK3CA | E545K | 1.3% |
0.1% 等位基因突变频率 Multiplex I cfDNA 参考标准品 (组份货号: HD814) | |||
染色体 | 基因 | 突变类型 | 预期等位基因突变频率 % |
7p12 | EGFR | L858R | 0.10% |
7p12 | EGFR | ΔE746 - A750 | 0.10% |
7p12 | EGFR | T790M | 0.10% |
7p12 | EGFR | V769 - D770insASV | 0.10% |
12p12.1 | KRAS | G12D | 0.13% |
1p13.2 | NRAS | Q61K | 0.13% |
1p13.2 | NRAS | A59T | 0.13% |
3q26.3 | PIK3CA | E545K | 0.13% |