QuantSeq-Flex 靶向RNA-Seq文库构建试剂盒V2

QuantSeq-Flex RNA-Seq文库构建试剂盒V2是一个非常灵活的靶向建库试剂盒，使用者可用定制引物进行第一链和/或第二链合成，因此可进行靶向测序。同时在定量测序中，每个转录本只生产一个片段，确保定量结果准确。

产品优势
试剂盒应用灵活，可用于靶向测序；
>100多重引物的靶向文库构建；
每个转录本只生成一个片段—对基因表达精确定量；
识别已知和未知融合转录本；
只需4.5小时即可完成RNA文库构建；
节省测序成本，Dual index兼容多达9,216种组合（i5 / i7组合）。

工作流程
使用QuantSeq-Flex靶向RNA-seq文库构建试剂盒，根据使用的引物类型，可生成四种不同的文库:
1) Oligo(dT)用于第一链合成，随机引物用于第二链合成(Quantseq FWD)；
2) Oligo(dT)用第一链合成，特异性靶向引物用于第二链合成（靶向3’ mRNA-Seq）；
3) 特异性靶向引物用于第一链合成，随机引物用于第二链合成（靶向RNA-seq，可用于发现新的融合基因）；
4) 特异性靶向引物用于第一链及第二链合成（靶向RNAseq，只检测已知目标基因）。

Fig.2所示，靶向引物构建的文库。针对丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B-raf (BRAF, NM_004333.4)、受体酪氨酸蛋白激酶erbB-2 (ERBB2, NM_001005862.2)和KRAS原癌基因GTPase (KRAS, NM_004985.4)设计了引物，以K562细胞的总RNA为模板，用QuantSeq-Flex试剂盒进行建库。Fig.3展示以不同RNA起始量(500ng, 100ng和10ng)检测BCR-ABL基因的融合转录本。

Figure 2 | 靶向引物构建的文库。针对丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B-raf (BRAF,NM_004333.4)，受体酪氨酸蛋白激酶erbB-2 (ERBB2, NM_001005862.2)和KRAS原癌基因,GTPase (KRAS, NM_004985.4)设计了引物，以K562细胞的总RNA为模板用QuantSeq-Flex试剂盒进行建库。

Figure 3 | BCR-ABL融合基因靶向文库的片段分析。

Figure 1 | QuantSeq-Flex靶向RNA-Seq建库试剂盒V2工作流程图。反转录反应可以使用oligo(dT)引物(包含在试剂盒中)，也可以使用目标特异性引物(不包含，为靶向定制)。第二链合成可以使用随机引物(包含在试剂盒中)或使用目标特异性引物(不包含，为靶向定制)。对于随机引物启动第二链合成，则需要进行RNA去除骤，当使用目标特异性引物合成第二链时，RNA去除步骤可省略。根据使用引物的类型，可生成四种不同的文库。

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