总RNA中包含大量核糖体RNA(rRNA),通常科研人员对这些rRNA不感兴趣。Lexogen公司的RiboCop rRNA 去除试剂盒可以高效地从完整的或降解的大鼠、小鼠和人类总RNA样本中去除rRNA。去除rRNA后的RNA样本可以用于二代测序(NGS),或其它需求的RNA分析应用。
产品优势
高度特异性去除(高达99.8 %)人类、小鼠、大鼠RNA样本中的细胞质rRNA (28S、18S、 5.8S、5S、45S)和线粒体rRNA (mt16S、 mt12S);
适用于完整高质量的或降解的RNA (如FFPE样本);
灵活的RNA input量 (1ng-1μg的总RNA input量);
自动化友好的操作流程—基于磁珠纯化流程;
简单稳定的工作流程—无酶促反应和机械剪切步骤;
可以与任何RNA-seq文库构建试剂盒无缝对接 (包括Lexogen公司的CORALL Total RNA-Seq);
NEW V2! 流程更快:1.5小时内即可完成rRNA去除(包括20 min的手动操作时间)。
工作流程
亲和探针和总RNA (1 ng – 1 μg)一起混合并变性,促进探针结合靶标序列。然后,在高温下进行RNA和探针的杂交,同时,rRNA去除磁珠可以从溶液中除去探针和杂交的核糖体RNA。最后用磁珠纯化剩余的RNA完成整个过程。整个流程通过使用磁珠达到rRNA的清除和纯化的目的,便于实现自动化操作,并可在2小时内快速、便捷的除去rRNA。
Figure 1 | RiboCop工作流程图。
性能表现
RiboCop可高效地去除人类、大鼠和小鼠RNA样本中的rRNA(高达99.8%)(表1)。即使是高度降解的样本如FFPE(第3列),同样可以用RiboCop去除rRNA。通常回收率为RNA input量的1-3%,同时高度取决于input的材料。此外,RiboCop的重复性好。对于input量为100ng或10ng的UHRR样本,重复结果的相关性R2分别为0.995和0.950。
Table 1 | Lexogen的RiboCop rRNA去除试剂盒V1.3可以达到99.8%的rRNA去除效率。RiboCop去除rRNA后,建库并在HiSeq仪器上测序。测序结果与rRNA参考序列比对,并以对应的未清除rRNA的文库为参考进行定量。表格中的数据为100 ng总RNA每反应的input量。UHRR — 通用的人类参考RNA;HBRR — 人类大脑参考RNA;mt rRNA — 线粒体rRNA。
转录本表达定量无偏差
重复性好
RiboCop HMR+Globin可有效同时去除全血RNA样本中的rRNA以及globin mRNA
RiboCop HMR+Globin提高全血样本的基因检出率
订购信息:
Product # | Product | Kit Size |
144.24 | RiboCop rRNA Depletion Kit for Human/Mouse/Rat (HMR) V2, 24 preps | 24 |
144.96 | RiboCop rRNA Depletion Kit for Human/Mouse/Rat (HMR) V2, 96 preps | 96 |
145.24 | RiboCop rRNA Depletion Kit for Human/Mouse/Rat plus Globin (HMR+Globin), 24 preps | 24 |
145.96 | RiboCop rRNA Depletion Kit for Human/Mouse/Rat plus Globin (HMR+Globin), 96 preps | 96 |