低通量(1-4靶标)空间原位检测服务
——解码空间奥秘
靶向空间组学技术,具有高灵敏度、高特异性以及高分辨率等特性,可实现单碱基和亚细胞分辨率的基因定性与定量检测。针对客户的需求,普凯瑞生物可提供不同的空间原文检测技术,灵活的满足低通量基因的组织细胞精准定位;单细胞空间图谱绘制;三维空间图谱构筑;RNA/蛋白共检;宿主微生物双重空间组分析等等。可将空间组学与单细胞测序联合应用,可实现高分辨的单细胞空间图谱构建,以及空间表达图谱的原位验证,是单细胞测序、空间转录组测序下游验证必备工具。广泛适用于科研和临床领域,助力生命科学研究与临床精准诊断。
多种技术可选:
灵活设计,满足不同应用需求
a) π-FISH技术
独特的π字形杂交探针设计(含2-4个互补碱基对),既保证了靶标杂交的特异性,又可以为后续分支放大提供稳定的支撑结构;同时结合U型放大系统,实现信号上千倍放大,从而使其具有更好的特异性和更高灵敏度,相较于传统FISH方法(smFISH和HCR等),杂交效率更高、背景噪音更低和信号放大能力更强;

技术优势:
1. 背景荧光信号低、特异性好,荧光信号高
2. 广泛的物种适用性,可用于动物、植物和微生物(细菌,病毒和寄生虫等)样品的检测,不拘泥于样本制备的限制,适用于细胞、冰冻组织、石蜡组织和整胚样品等检测。

3. 可以实现DNA、RNA和蛋白质多重分子共同检测。π-FISH rainbow 检测了 HeLa 细胞中 lncRNA NEAT1、Pol II 蛋白和 MAPK15 基因组位点的空间分布,证明了该技术可以实现DNA、RNA 和蛋白质共同检测,这一突破对破译生物大分子复合物参与生命活动调控机制的研究具有十分重要意义。

4. π-FISH 可高效检测短序列RNA(如microRNA)、短序列DNA(如DNA突变、倒位、异位)以及可变剪接等分子。通过将π-FISH rainbow与HCR技术结合,开发了π-FISH+技术,以检测短核酸片段microRNA、选择性剪接变体和短DNA位点,并成功鉴定了前列腺癌患者循环肿瘤细胞中雄激素治疗抵抗标志物雄激素受体剪接变体7 (ARV7),解决了前列腺癌治疗中缺乏精准诊断的难题,为前列腺癌患者雄激素耐药性治疗提供了重要的临床指导。

a-b:π-FISH+技术对microRNA (miR145-5p)及其相互作用的lncRNA (MALAT1)检测;c-g:在阳性/阴性细胞系LNCaP和PC3中针对AR-V7剪切变体的检测。
b) SEERNA® CISH技术
SEERNA® CISH是基于单分子RNA显色原位杂交技术(single molecule chromogenic in situ hybridization, smCISH)开发,该技术基于DNA锁式探针和滚环扩增技术,可特异性对mRNA和部分lncRNA等单靶标基因的组织原位表达定位和验证,具有高效率检出、高特异性以及实验耗时短等优点。该技术更适用于自发荧光背景高且无多靶标共检需求的样本,例如临床FFPE样本开展某个靶点或Biomarker的RNA表达验证工作,也可用于HIV、HCV和HPV等外源性感染病毒的组织检测。

产品优势
(1)具有高检出、高特异、耗时短的优点
(2)可应用于神经、肿瘤、发育及药物开发等领域
(3)适用于多种组织类型(人、小鼠的多种组织来源)、多种样本制备方式(实现常规样本类型全覆盖)
(4)更适用于自发荧光背景高且无多靶标共检需求的样本
数据展示
(1) 乳腺癌样本HER2检测(非特殊型浸润性癌)

(2) lncRNA原位杂交检测结果

(3) HPV E6/E7 mRNA原位杂交检测结果

c) SEERNA® FISH技术
SEERNA® FISH 技术可以针对mRNA或lncRNA等靶标RNA分子定制探针,进行RNA表达水平和空间位置验证。该产品一次可以同时验证1~4个靶标,提供了一种亚细胞分辨率、高灵敏度、高特异性的科研验证工具。非常适合用于NGS或者scRNA-seq组学挖掘关键靶标或者marker分子的表达位置验证,尤其是验证缺乏有效抗体的RNA分子以及分泌性蛋白;也可用于HIV、HCV和HPV等外源性感染病毒的组织检测;在药物开发中可用于临床前药物靶点验证以及药物毒性评估等环节。

产品优势
(1)高灵敏度
每个靶基因设计5-10对不等的探针,通过滚环扩增信号放大提升了检测灵敏度和信噪比。
(2)高特异性
双连接探针设计确保了靶向特异性结合,抑制非特异性杂交信号产生扩增。
(3)保留形态学特征
无需圈选区域,全景检测,可在复杂的组织环境中进行基因表达空间分析
(4)单细胞水平定量
高灵敏度和形态学特征的结合实现了单细胞分辨率上的单分子检测。
(5)适用样本类型
新鲜冰冻组织切片;FFPE组织切片;固定后冰冻组织切片,细胞爬片等。
植物项目样本情况:

项目流程

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